マッピングツールはいずれも，高速性を実現するため，アラインメント領域を限定している．long seedアプローチは，30bp程度の長いseedを用いて，seed周辺領域についてのみペアワイズアラインメントを計算する．ここでseedとは，ギャップを含まない配列類似度の高い領域のことである．長いseedを用いることで計算が高速になる代わりに，マッピング感度が低下する．（実験医学増刊2915より）

使えるデータベース・ウェブツール

日本発のデータベース戦略から，ゲノム・疾患情報の有効活用まで

有田正規／編